Дело в том что ЕС это не какая то внешняя и отдельная политическая структура. Еврокомииссиа состоит из премерминистров стран членов ЕС, то есть конечно они дают органам ЕС только такие инструменты которые выгодны им лично на национальном уровне. Политическую независимость от власти стран членов имеет Европарламент, но в то же время он имеет почти только легислативные полномочия.